Не знаю писали об этом или нет. На всякий случай напишу ещё раз. Проблема с Hotkey'ми, удаляю с помощью Backspace любые назначенные хоткеи, но после создания новой сцены, или захода в любое меню, например Preferences, все удаленные хоткеи возвращаются назад. Пробовал сохранять Hotkeys в файл и загружать, все-равно восстанавливаются. Пробовал и на PC и на Mac компьютере, тоже самое.